Siamo nel 23° secolo, il Pianeta ha immense difficoltà energetiche ed ecologiche e il capitano Spock non ha ancora ripreso la sua totale forma originaria. L'imminente necessità del capitano Kirk per recuperare entrambi è quella di catturare due balene (una specie ormai estinta in quel periodo). L'unica strada percorribile è affrontare un viaggio nel tempo che porterà i protagonisti nella California del 1986 alla ricerca dei cetacei. Non sarà per nulla semplice scovare i due esemplari e soprattutto trasportarle nel tempo.
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