Quando un tornado fa la sua comparsa nelle acque a sud di Boston, l'ex cacciatore di tempeste Joe Randall è incuriosito dall'insolito evento. Quando però diversi cicloni cominciano ad abbattersi su tutta la costa, Joe si rende conto di essere di fronte a qualcosa di mai visto. Con tutta la città sotto assedio, Joe, la sorella Maddy e il vecchio compagno di caccia alle tempeste Lee, si rendono presto conto di essere di fronte a uno strano e inedito fenomeno meteorologico conosciuto come "stonado", capace di scatenare piogge di gigantesche e distruttive pietre.